但历史赋予黄河流域和开封的苦难并未终结。
金哀宗开兴元年（1232年），在蒙古人的一路追击下，金哀宗不得不南下逃到开封，随后又逃到距离开封仅仅100多公里远的归德（商丘），当时，金兵试图扒开黄河水淹蒙古军队，结果派出去扒堤的部队全军覆没。
随后，获知消息的蒙古军队一不做二不休，直接来了个将计就计想水淹归德（商丘），蒙古人随后扒开了黄河大堤，但没想到归德（商丘）城地势高，黄河水竟然绕城而去，但泛滥的黄河，却给开封周边造成了巨大危害。
蒙古人扒开黄河两年后，1234年，趁着金朝危亡，当时南宋军队北上与蒙古人争夺中原，为了阻挡宋朝军队，蒙古人再次人为扒开黄河，这一次地点则选择在了距离开封城北仅仅20多里的寸金淀，这也造成了黄河历史上的第五次大改道。
从1127年到1234年，由宋人与蒙古人轮流共三次扒开黄河的结果，除了导致黄河频繁大改道之外，也给开封造成了几乎毁灭性的打击。
在北宋以前，黄河当时距离开封有200里之远，但是从北宋开始的黄河频繁决堤，加上整个南宋时期宋人与蒙古人的三次轮流扒堤，这种天灾与人祸的叠加，导致的直接结果，就是黄河河道逐渐向南迁徙，日益逼近开封城。
到了1234年蒙古人再次扒开黄河大堤后，当时黄河距离开封城的直线距离，已经从北宋前的200里远，变成了距离仅仅20里远。