本文的表现形式和手法非常独特，采用小品文的形式，以梅喻人，借题发挥。全文共三段，第一段剖析了产生病梅的根由；第二段表明自己疗梅的行动和决心；第三段抒写自己辟馆疗梅的苦心。文章无处不写梅，但只是曲笔，目的是要托梅议政。文章夹叙夹议，结构严谨，篇幅短小却有深刻的内涵。
这篇文章可以同作者著名的《己亥杂诗》联系来看：“九州生气恃风雷，万马齐喑究可哀。我劝天公重抖擞，不拘一格降人才。”万马齐喑的局面就是病梅遍地的情形，在此形势下，想要国家焕发生气，必须大胆革新，不拘一格地选拔人才。《病梅馆记》和《己亥杂诗》虽诗文异体，而思想同质。
【辑评】
孜孜创新，一空依傍，把向来的格调，都解放了。……龚氏是全力改革文学，无论是教导诗文词，都能自成一家，思想亦奇警可喜，实是新文学的先驱者。（龚氏的文体，实在发源于诸子）。
……
全篇都是比喻，说得多么痛快，那时能有这种反抗思想，是不易得的。
